Doktora Tezi Görüntüleme

Öğrenci: Dilşat Nigar ÇOLAK
Danışman: Prof. Dr. Ali Osman BELDÜZ
Anabilim Dalı: Biyoloji
Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
Üniversite: Karadeniz Teknik Üniversitesi
Tez Adı: Acidithiobacillus ferrooxidans M1 YABAN TİP ve MUTANT (Q9F ve S21Y/V22D) DEMİR OKSİDAZLARININ BİYOKİMYASAL KARAKTERİZASYONU
Tezin Türü: Doktora
Kabul Tarihi: 30/5/2014
Sayfa Sayısı: 88
Tez No: Dt1020
Özet:

      

Murgul bakır madeninden izole edilen Acidithiobacillus ferrooxidans M1 suşunun demir oksidaz proteinini kodlayan iro geni klonlanarak izole edildi ve baz dizilimi belirlendi. İzole edilen gen, pET-28a(+) ekspresyon vektörüne klonlanarak E. coli BL21(DE3) suşu içerisinde yüksek miktarlarda üretildi. Demir oksidaz proteinine ait korunmuş bölgeler incelenerek, bölge özgün mutasyon yöntemiyle, klonlanan demir oksidaz üzerinde Q9F ve S21Y/V22D mutasyonları yapıldı. Yaban tip ve mutant enzimler saflaştırıldı ve karakterize edildi. Mutant enzimler yaban tip enzim ile biyokimyasal özellikleri ve kinetik parametreleri bakımından karşılaştırıldı. Yaban tip enzimin optimum pH’sı 4,0, optimum sıcaklığı 25°C, Km’si 0,27 ± 0,09 mM ve Vmax’ı ise 0,083 ± 0,01 μmol/dk/mg protein olarak belirlendi. Yapılan mutasyonlar enzimin kinetik parametrelerinde önemli bir değişiklik meydana getirmezken, her iki mutantın optimum pH’sı da 3,5 olarak belirlendi. Ayrıca S21Y/V22D mutantında pH kararlılığının arttığı görüldü.