Doktora Tezi Görüntüleme

Öğrenci:	Elif SEVİM
Danışman:	Prof. Dr. Ali Osman BELDÜZ
Anabilim Dalı:	Biyoloji
Enstitü:	Fen Bilimleri Enstitüsü
Üniversite:	Karadeniz Teknik Üniversitesi

Tez Adı:	Aeribacillus pallidus AC6’DA YÜKSEK SEVİYEDE EKSPRES EDİLEN FLAGELLİN GENİNİN (hag) KLONLANMASI, PROMOTOR YAPISI, FLAGELLAR SPESİFİK TRANSKRİPSİYON FAKTÖRÜNÜN (SİGMA-D) İZOLASYONU ve SAFLAŞTIRILMASI
Tezin Türü:	Doktora
Kabul Tarihi:	24/9/2010
Sayfa Sayısı:	142
Tez No:	Dt803

Özet:

5’-RACE tekniği ile flagellin geninin transkripsiyon başlama bölgesinin translasyon başlama kodonundan 79 ve 80 bp upstream bölgede yer alan G ve T bazları olduğunu gösterildi. Transkripsiyon başlama kodunu belirlendikten sonra incelenen upstream bölgede σD faktör tarafından tanınan promotor bölge sekanslarının varlığı gözlemlendi. Yapılan β-galaktosidaz deneyi sonucunda, AC6 hag geninin -35 bölgede TAAA sekanslarına, -10 bölgede CCGATAT sekanslarına sahip olduğu ve bu sekansların bakteriyel RNAP enziminin σD faktörü tarafından tanındığı tespit edildi.

AC6 hag geni mRNA’sının sekonder yapısı incelendiğinde, hag transkriplerinin 5’ ve 3’ uçlarında stem-loop yapılarının varlığı tespit edildi. AC6 hag geni için tercih edilen kodonların B. subtilis bakterisi için yüksek sıklıkta kullanılan, G. kaustophilus ve G. stearothermophilus bakterileri için düşük sıklıkta kullanılan a.a. kodonları olduğu tespit edildi.

Anahtar Kelimeler: Flagellin geni (hag), σD, Aeribacillus pallidus AC6, hag promotor elementleri, in vitro transkripsiyon